Zwierzęta znakuje się, aby łatwo można było je zidentyfikować i śledzić ich pochodzenie, zdrowie oraz ruchy migracyjne.
Paszporty dla zwierząt, podobnie jak dla ludzi, są dokumentami tożsamości umożliwiającymi legalne przemieszczanie się poza granicami kraju.
Są one szczególnie ważne dla zwierząt domowych. Umożliwiają właścicielom udowodnienie, że ich zwierzęta są zdrowe i nie stanowią zagrożenia dla innych.